View source for COVID-19 parameters for Nasopharynx

<center>
{| class="wikitable"
!Имя параметра!!Расшифровка!!Значение!!Единицы измерения!!Источник
|-
|K_virus_appear||начальная доза вируса или количество вирионов на единицу объема||||||
|-
|K_virus_degradation||константа скорости "естественной" деградации (диссипация) вируса||0.7957||d^-1||значение взято как среднее значений из https://doi.org/10.1073/pnas.2017962118
|-
|K_ACE2_regeneration||константа скорости регенерации ACE2-клеток||0.57||fmol/ml/h||это значение для легких взято из Voutouri et al., 2021, PNAS; https://doi.org/10.1073/pnas.2021642118, есть также значение 7x 10-3 измеряемое в mM/min взято из https://doi.org/10.1073/pnas.2021642118
|-
|K_infection_ACE2||константа скорости инфицирования "здоровых" ACE2-клеток||136000.0||1/M/s||взято для кишечника из Voutouri et al., 2021, PNAS; https://doi.org/10.1073/pnas.2021642118, еще есть значение 17 ml/h/nmol взято для кишечника из Voutouri et al., 2021, PNAS; https://doi.org/10.1073/pnas.2021642118
|-
|K_activation_ACE2_inf_unpackage_by_T_killer||пороговая концентрация T-killer клеток (CD8-CD3, далее T-killer), при которой активируется "распаковка" (разрушение) инфицированных ACE2-клеток - образование новых SARS-CoV-2 вирионов||||||
|-
|K_death_ACE2infected||константа скорости "естественной" гибели инфицированных ACE2-клеток||в легких и кишечнике различается в 10 раз||||
|-
|K_death_ACE2infected_with_Tkiller||константа скорости деградации инфицированных ACE2-клеток при помощи T-killer клеток||||||
|-
|K_inh_by_ACE2_infected||пороговое количество инфицированных ACE2-клеток, при котором они начинают ингибировать регенерацию ACE2-клеток||||||
|-
|K_saturation_ACE2_inf_unpackage_by_T_killer||пороговая концентрация T-killer клеток, при которой происходит насыщение их активирующего воздействия на "распаковку" инфицированных ACE2-клеток||||||
|-
|K_unpackage_ACE2_infected||константа скорости "распаковки" инфицированных ACE2-клеток или скорость высвобождения нового вируса в соответствующем компартменте организма||0.0076||1/min||www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2021642118
|-
|K_Tkiller_appear||константа скорости образования T-killer клеток||5-7 дней||||
|-
|K_Tkiller_death||константа скорости "естественной" гибели T-killer клеток||14 дней||||
|-
|K_inh_Tkiller_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой он подавляет появление новых T-killer клеток||||||
|-
|K_inh_Tkiller_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он подавляет появление новых T-killer клеток||||||
|-
|K_T4helper_appear||константа скорости образования T4-helper (CD4-CD3, далее T4-helper) клеток||||||
|-
|K_T4helper_death||константа скорости "естественной" гибели T4-helper клеток||2 недели, кроме клеток памяти, но зависит от воспаления||||
|-
|K_act_T4helper_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой он активирует производство T4-helper клеток||||||
|-
|K_act_T4helper_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он активирует производство T4-helper клеток||||||
|-
|K_act_degradation_T4helper_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он активирует деградацию T4-helper клеток||||||
|-
|K_diff_T4_helper||константа скорости дифференцировки T4-helper клеток в T-killer ||0.00254||1/h||взято для кишечника из Estimate Lai, X Friedman A.
|-
|K_sat_T4helper_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаление, при которой происходит насыщение его активирующего воздействия на производство T4-helper клеток||||||
|-
|K_sat_T4helper_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой происходит насыщение его активирующего воздействия на производство T4-helper клеток||||||
|-
|K_sat_degradation_T4helper_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой происходит насыщение его активирующего воздействия на деградацию T4-helper клеток||
|-
|K_diff_naiveB_into_activeB_cells||константа скорости дифференцировки наивных В-клеток в функционально активные B-клетки (продуцирующие антитела IgM, IgG, IgA)||неделя; на два дня дольше, чем Т клетки||||
|-
|K_inh_naiveB_cells_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой он подавляет производство наивных В-клеток||||||
|-
|K_inh_naiveB_cells_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он подавляет производство наивных В-клеток||||||
|-
|K_naiveB_cells_appear||константа скорости образования наивных В-клеток при активации антиген-презентрирующих сайтов (далее АПС)||||||
|-
|K_naiveB_cells_death||константа скорости "естественной" гибели наивных В-клеток ||две недели||||
|-
|psi_B_naive||константа скорости пролиферации наивных B-клеток||||||
|-
|K_act_activeB_cells_by_T4_helper||пороговая концентрация T4-helper клеток, при которой они начинают активировать производство функционально активных В-клеток||||||
|-
|K_act_death_activeB_cells_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой он активирует деградацию функционально активных В-клеток||||||
|-
|K_act_death_activeB_cells_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он активирует деградацию функционально активных В-клеток||||||
|-
|K_activated_B_cells_death||константа скорости "естественной" гибели функционально активных В-клеток||||||
|-
|K_inh_activeB_cells_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой он ингибирует дифференцировку наивных B-клеток в функционально активные||||||
|-
|K_sat_activeB_cells_by_T4_helper||пороговая концентрация T4-helper клеток, при которой происходит насыщение их активирующего воздействия на дифференцировку наивных B-клеток в функционально активные||||||
|-
|K_sat_activeB_cells_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой происходит насыщение его активирующего воздействия на деградацию функционально активных B-клеток||||||
|-
|K_sat_activeB_cells_by_virus||пороговая концентрация вируса, при которой происходит насыщение его активирующего воздействия на деградацию функционально активных B-клеток||||||
|-
|K_act_Sa||константа конститутивной скорости активации АПС||||||
|-
|K_psi||пороговая концентрация вируса, при которой происходит активации АПС||||||
|-
|sigma_S_a||константа скорости диссипации АПС||зависит от воспаления и частоты контактов с СD4 CD21||||
|-
|sigma_m||эффективность активации АПС вирусом, в связанном с антителом состоянии||||||
|-
|K_IgA_death||константа скорости деградации IgA||1.5||месяц||в таблице нет референса
|-
|K_IgA_income||константа скорости продукции IgA функционально активными В-клетками||100.0||pg/cell/day||Long-Lived Plasma Cells from Human Small Intestine Biopsies Secrete Immunoglobulins for Many Weeks In Vitro | The Journal of Immunology (jimmunol.org)
|-
|K_bind_IgA||константа связывания вируса с IgA||||||
|-
|K_unbind_IgA||константа диссоциации комплекса вируса-IgA||||||
|-
|K_IgM_death||константа скорости деградации IgM||||||
|-
|K_IgM_income||константа скорости продукции IgМ функционально активными В-клетками||40||||
|-
|K_bind_IgM||константа связывания вируса с IgM||||||
|-
|K_unbind_IgM||константа диссоциации комплекса вируса-IgM||||||
|-
|K_IgG_death||константа скорости деградации IgG||1.5||месяц||
|-
|K_IgG_income||константа скорости продукции IgG функционально активными В-клетками||200||||
|-
|K_bind_IgG||константа связывания вируса с IgG||||||
|-
|K_unbind_IgG||константа диссоциации комплекса вируса-IgG||||||
|-
|K_act_inflam_by_IgG||пороговая концентрация IgG, при которой происходит активация процесса воспаления||линейная зависимость||||
|-
|K_act_inflam_by_IgM||пороговая концентрация IgМ, при которой происходит активация процесса воспаления||тоже линейная зависимость||||
|-
|K_inflammation||константа конститутивной скорости процесса воспаленения (без учета активирующего воздействия антителами)||||||
|-
|K_inflammation_death||константа скорости диссипации "агента" воспаления||выведение провоспалительных цитокинов почками обычно за 8-12 часов||||
|-
|K_inh_inflam_by_IgA||пороговая концентрация IgA, при которой они ингибируют процесс воспаления||а это лучше увязать через вирусную нагрузку ане ингибирование процесса воспаления||||
|-
|K_FOXP3_activated_death||константа скорости "естественной" гибели функционально активных FOXP3 клеток||аналогично всем остальным клеткам кроме клетко памяти||||
|-
|K_FOXP3_naive_appear||константа скорости пролиферации наивных FOXP3 клеток||идентично всем остальным||||
|-
|K_diff_FOXP3_naive||константа скорости дифференцировки наивных FOXP3 клеток в функционально активные||варьирует от воспаления. а сроки диффренцировки идентичны с остальными клетками, различается множественность пролиферации||||
|-
|K_inh_FOXP3_by_inflammation||пороговая концентрация "агента" воспаления, при которой он ингибирует дифференцировку наивных FOXP3 клеток в функционально активные||||||
|-
|B_0||начальная концентрация наивных B-клеток||10-40 тыс на эпитоп||||
|-
|S_0||суммарное количество неактивных (S_n) и активных (S_a) АПС||||||
|-
|area of mucinous||площадь слизистой, без учета желез и многослойности эпителия||0.2||m2||
|}
</center>