BioUML platform - New pages [en]

Bioumlsim

2023-09-15T12:35:15Z

Axec@dote.ru:

bioumlsim is a Python library providing API for BioUML simulation capabilities. Python 3.6. is required!

Source code is avaliable at [https://github.com/Biosoft-ru/bioumlsim| github] and [https://pypi.org/project/bioumlsim/| PYPI].

It can be installed via pip:

pip insall bioumlsim

All neccessary Java libraries are already embedded into library and are downloaded along with python code.

Demo python code:

import bioumlsim
bsim = bioumlsim.Bioumlsim() #Here JVM is starting
model = bsim.loadTest() #To load your own model replace it with "model = bsim.load(PATH_TO_SBML)"
result = model.simulate(100,10) #first argument: completion time, second argument: number of time points
bsim.plot(result) #plot simulation result

Developed models

2022-07-28T05:44:03Z

Akberdinir@gmail.com: Created page with " Список созданных и воспроизведенных в рамках проекта математических моделей предст..."

Список созданных и воспроизведенных в рамках проекта математических моделей представлен [http://wiki.biouml.org/images/0/0e/%D0%9F%D1%80%D0%B8%D0%BB%D0%BE%D0%B6%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D0%A2%D0%B0%D0%B1%D0%BB%D0%B8%D1%86%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%B4%D0%B5%D0%BB%D0%B5%D0%B9.pdf тут]

Tutorials

2022-07-27T07:00:19Z

Akberdinir@gmail.com:

Для обучения и подготовки специалистов в области вирусологии, иммунологии, эпидемиологии и экономики по вопросам SARS-CoV-2 и его пандемии, был разработан соответствующий учебный курс, включающий компьютерные практикумы:

1. [http://wiki.biouml.org/images/3/32/%D0%9C%D0%B5%D1%82%D0%BE%D0%B4%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%B5_%D0%BF%D0%BE%D1%81%D0%BE%D0%B1%D0%B8%D0%B5_%D0%BC%D0%B0%D1%82%D0%B5%D0%BC%D0%B0%D1%82%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%B5_%D0%BC%D0%BE%D0%B4%D0%B5%D0%BB%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5.pdf Методические рекомендации к компьютерному практикуму “Математическое моделирование коронавирусных инфекций”]

2.[http://wiki.biouml.org/images/a/a8/%D0%9C%D0%B5%D1%82%D0%BE%D0%B4%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D0%BA%D0%BE%D0%B5_%D0%BF%D0%BE%D1%81%D0%BE%D0%B1%D0%B8%D0%B5_%D1%8D%D1%84%D1%84%D0%B5%D0%BA%D1%82%D0%B8%D0%B2%D0%BD%D0%BE%D1%81%D1%82%D1%8C_%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D0%B0%D1%80%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D1%85_%D0%BF%D1%80%D0%B5%D0%BF%D0%B0%D1%80%D0%B0%D1%82%D0%BE%D0%B2.pdf Методические рекомендации “Оценка эффективности лекарственных препаратов и схем лечения при коронавирусных инфекциях”].